37分院位于鄒城市公園路2號,創建于1966年5月,1993年通過一級甲等醫院評審。
濟三分院位于鄒城市龍山北路118號,創建于1959年9月。1999年通過一級甲等醫院評審。
濟二分院位于鄒城市龍山路599號,創建于1958年5月。1999年通過一級甲等醫院評審。
魯化分院位于滕州市木石鎮,創建于1967年10月,2018年12月醫院改制納入總醫院管理。
礦山分院系原兗礦集團大陸機械有限公司職工醫院,位于兗州區經濟開發區,創建于1958年10月,于2014年7月1日劃轉兗礦集團總醫院。1999年通過一級甲等醫院評審。
唐村分院位于鄒城市唐村鎮駐地,創建于1975年5月,1999年通過一級甲等醫院評審。